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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6zxez_ | 3.00 | PDB header: ribosome | Chain: Z: PDB Molecule: 40s ribosomal protein s25; |
Added to library: Sat Dec 5 09:44:17 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | P | R | T | R | M | I | L | F | K | M | L | T | R | G | I | I | T | E | I | N | G | C | I | S | T | G | K | E | A | N | V | Y | H | A | S | T | A | N | G | E | S | R | A | I | K | I | Y | P | R | K | M | V | K | T | W | A | E | K | E | M | R | N | L | I | R | L | N | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | I | P | C | P | E | P | I | M | L | R | S | H | V | L | V | M | S | F | I | G | K | D | D | M | P | A | P | L | L | K | N | V | Q | L | S | E | S | K | A | R | E | L | Y | L | Q | V | I | Q | Y | M | R | R | M | Y | Q | D | A | R | L | V | H | A | D | L | S | E | F | N | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | B | T | T | S | B | B | T | T | T | S | T | T | T | T | B | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | Y | H | G | G | G | V | Y | I | I | D | V | S | Q | S | V | E | H | D | H | P | H | A | L | E | F | L | R | K | D | C | A | N | V | N | D | F | F | M | R | H | S | V | A | V | M | T | V | R | E | L | F | E | F | V | T | D | P | S | I | T | H | E | N | M | D | A | Y | L | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | B | S | S | T | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . |
Sequence | K | A | M | E | I | A | S | Q | R | T | K | E | E | R | S | S | Q | D | H | V | D | E | E | V | F | K | K | K | E | R | K | K | M | V | K | E | A | Q | R | E | K | R | K | N | K | I | P | K | H | V | K | K | R | K | E | |||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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