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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6zxcD_ | 2.80 | PDB header: signaling protein | Chain: D: PDB Molecule: putative ggdef/response regulator receiver domain protein; |
Added to library: Sat Apr 3 09:31:14 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | R | K | I | L | I | I | E | D | S | E | L | Q | R | K | L | L | S | R | W | V | S | K | N | G | Y | I | A | I | E | A | E | S | I | S | V | A | R | E | K | I | I | S | E | S | I | D | V | V | L | L | W | E | L | P | D | G | N | G | I | D | L | I | S | D | I | L | S | T | S | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | G | W | L | P | I | I | M | V | T | G | H | T | E | P | E | Y | F | K | I | A | I | E | A | G | A | T | D | Y | I | T | K | P | A | K | E | I | E | L | L | A | R | I | F | S | A | L | R | I | K | A | L | H | D | Q | L | R | E | T | A | I | R | D | V | M | T | G | L | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | S | B | T | T | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | R | Y | M | E | E | R | I | E | Q | E | F | Q | R | C | K | R | H | D | S | L | L | S | M | A | M | I | D | I | D | K | F | K | N | I | N | D | T | Y | G | H | E | I | G | D | Q | V | I | K | Q | L | A | H | E | L | K | T | S | F | A | K | S | A | I | I | S | R | F | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | E | E | F | V | I | L | F | P | E | T | G | V | V | D | A | T | R | I | L | D | R | V | R | E | N | V | S | K | L | E | M | K | S | D | T | D | Q | I | F | H | F | T | F | S | G | G | V | A | G | G | D | L | S | D | I | Q | S | N | Q | E | L | L | K | I | A | D | K | N | L | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | A | K | S | S | G | R | N | Q | I | I | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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