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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6zbhC_ | 3.60 | PDB header: membrane protein | Chain: C: PDB Molecule: merozoite surface protein-1; |
Added to library: Sat May 22 08:43:12 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | V | A | V | S | S | P | L | T | V | L | S | I | S | N | D | L | K | G | I | V | S | L | L | N | L | G | N | K | T | K | V | P | N | P | L | T | I | S | T | T | E | M | E | K | F | Y | E | N | I | L | K | N | N | D | T | Y | F | N | D | D | I | K | Q | F | V | K | S | N | S | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | I | T | G | L | T | E | T | Q | K | N | A | L | N | D | E | I | K | K | L | K | D | T | L | Q | L | S | F | D | L | Y | N | K | Y | K | L | K | L | D | R | L | F | N | K | K | K | E | L | G | Q | D | K | M | Q | I | K | K | L | T | L | L | K | E | Q | L | E | S | K | L | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | L | N | N | P | H | N | V | L | Q | N | F | S | V | F | F | N | K | K | K | E | A | E | I | A | E | T | E | N | T | L | E | N | T | K | I | L | L | K | H | Y | K | G | L | V | K | Y | Y | N | G | E | S | S | P | L | K | T | L | S | E | V | S | I | Q | T | E | D | N | Y | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | N | L | E | K | F | R | V | L | S | K | I | D | G | K | L | N | D | N | L | H | L | G | K | K | K | L | S | F | L | S | S | G | L | H | H | L | I | T | E | L | K | E | V | I | K | N | K | N | Y | T | G | N | S | P | S | E | N | N | K | K | V | N | E | A | L | K | S | Y | E | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | T | G | G |   | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | L | P | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | S |
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