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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ysiB_ | 2.50 | PDB header: ribosome | Chain: B: PDB Molecule: 50s ribosomal protein l3; |
Added to library: Sat Sep 19 08:44:33 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | I | G | L | V | G | R | K | C | G | M | T | R | I | F | T | D | A | G | V | S | V | P | V | T | V | I | E | V | D | P | N | R | I | T | Q | I | K | T | L | E | T | D | G | Y | Q | A | V | Q | V | T | T | G | E | R | R | E | S | R | V | T | N | A | Q | K | G | H | F | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | G | V | A | A | G | R | L | V | K | E | F | R | V | T | E | A | E | L | E | G | R | E | V | G | G | T | I | G | V | D | L | F | T | V | G | Q | I | V | D | V | T | G | Q | S | K | G | K | G | F | Q | G | G | V | K | R | W | N | F | R | T | Q | D | A | T | H | G | N | S | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | H | R | V | L | G | S | T | G | Q | N | Q | T | P | G | R | V | F | K | G | K | K | M | A | G | H | L | G | D | E | R | V | T | V | Q | G | L | E | I | V | S | V | D | T | E | R | S | V | L | V | V | K | G | A | I | P | G | A | T | G | G | D | V | I | V | R | P | T | I | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T | S |   | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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