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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6xqjA_ | UNK | PDB header: antiviral protein | Chain: A: PDB Molecule: protein vpr,uv excision repair protein rad23 homolog a; |
Added to library: Sat Nov 20 08:34:17 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | P | Y | N | E | W | T | L | E | L | L | E | E | L | K | S | E | A | V | R | H | F | P | R | I | W | L | H | N | L | G | Q | H | I | Y | E | T | Y | G | D | T | W | A | G | V | E | A | I | I | R | I | L | Q | Q | L | L | F | I | H | F | R | I | G | C | R | H | S | N | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | F | L | R | D | Q | P | Q | F | Q | N | M | R | Q | V | I | Q | Q | N | P | A | L | L | P | A | L | L | Q | Q | L | G | Q | E | N | P | Q | L | L | Q | Q | I | S | R | H | Q | E | Q | F | I | Q | M | L | N | E | P | P | I | Q | V | T | P | Q | E | K | E | A | I | E | R | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | S | T | T | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||
Sequence | K | A | L | G | F | P | E | S | L | V | I | Q | A | Y | F | A | C | E | K | N | E | N | L | A | A | N | F | L | L | S | Q | N | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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