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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6xp5R_ | 4.20 | PDB header: transcription | Chain: R: PDB Molecule: mediator of rna polymerase ii transcription subunit 18; |
Added to library: Sat Mar 6 08:37:10 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | Y | E | I | F | L | A | G | V | V | S | D | N | K | A | R | A | V | L | G | G | F | T | E | M | I | R | G | F | P | T | I | K | E | L | L | K | E | R | G | P | Q | E | L | H | N | I | L | V | R | Q | P | D | A | I | L | G | P | A | Q | A | G | A | E | A | A | P | H | G | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | S | G | G | K | P | H | I | L | R | W | S | D | I | P | D | P | P | N | Q | R | I | P | P | F | I | T | Q | R | K | I | I | E | I | P | D | Q | R | A | P | R | I | L | A | A | S | K | F | R | N | K | S | D | L | V | E | E | S | Y | H | W | W | F | N | D | V | E | Y | S | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | S | S | S | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | V | R | T | L | D | P | S | P | Q | T | T | D | Q | V | P | S | L | A | G | L | E | P | I | G | D | F | W | L | L | Y | V | R | M | R | V | E | A | T | P | D | R | M | Q | Q | A | H | N | Q | L | Q | Q | I | R | D | Q | L | L | G | V | F | E | F | K | V | W | D | R | |||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S | B | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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