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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6xn7J_ | 3.47 | PDB header: rna binding protein/rna | Chain: J: PDB Molecule: crispr-associated protein csm5; |
Added to library: Sat Jan 15 08:36:25 2022 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | M | K | K | T | Y | R | V | T | L | T | A | L | G | P | I | F | I | G | G | G | E | K | L | K | K | Y | E | Y | I | F | D | K | Q | K | K | V | A | H | M | I | D | H | T | K | F | T | K | Y | L | L | E | K | N | L | L | D | D | F | T | S | R | V | N | S | H | F | D | L | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | B | B | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | L | V | N | K | K | G | I | V | F | M | P | L | V | K | Y | S | V | P | V | A | Q | F | M | N | D | L | N | T | F | V | K | D | A | F | G | R | P | Y | I | P | G | S | S | L | K | G | A | L | R | T | A | I | L | N | D | L | K | E | D | T | K | E | N | E | V | F | A | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | S | S | S | B | S | B | B | T | T | B | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Q | V | S | D | S | E | T | I | D | L | E | N | L | K | V | Y | Q | K | V | D | Y | S | K | T | A | K | P | L | P | L | Y | R | E | C | L | K | P | N | T | E | I | T | F | T | V | S | F | D | D | E | Y | L | T | L | K | K | I | Q | N | A | L | H | K | T | Y | Q | H | Y | Y | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | K | W | L | K | G | G | K | V | G | E | T | L | I | K | G | V | T | F | A | L | D | Q | P | S | Q | N | Q | G | E | I | I | Y | I | G | G | G | A | G | F | V | S | K | T | L | H | Y | K | S | K | N | R | D | Q | A | R | N | D | S | F | D | I | L | K | Q | L | F | R | T | T | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | S | K | M | R | S | V | P | D | N | V | P | T | G | K | H | Y | L | E | M | G | K | A | R | I | K | L | E | E | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | B | B | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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