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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6xgrG_ | 3.50 | PDB header: viral protein | Chain: G: PDB Molecule: ysd1_22 major tail protein; |
Added to library: Sat Jul 4 09:39:12 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | D | N | Y | Q | N | N | Y | V | V | G | R | G | T | V | Y | F | D | R | F | Q | D | G | T | N | R | K | T | G | E | M | Y | F | G | N | T | P | E | F | T | I | N | T | D | S | E | T | L | D | H | Y | S | S | D | H | G | M | R | V | M | D | A | S | V | L | L | E | A | S | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | B | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | G | T | F | T | C | D | N | I | N | A | D | N | L | A | L | W | F | L | G | E | V | S | N | T | T | Q | T | Q | Q | T | D | A | K | E | V | F | N | P | I | M | R | G | R | Y | Y | Q | L | G | T | T | D | D | N | P | T | G | V | R | G | V | T | N | F | Q | M | V | K | A | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | S | I | A | I | S | V | G | S | G | D | I | T | S | I | V | G | A | T | V | V | N | P | A | G | N | Y | E | I | D | L | E | A | G | R | I | Y | I | E | P | D | S | T | D | L | S | G | N | V | Q | I | A | V | Q | Y | D | V | D | A | Q | K | R | T | L | V | I | G | K | S | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . |
Sequence | M | V | Y | G | A | L | R | M | I | S | D | N | P | V | G | L | N | K | N | Y | Y | F | P | K | V | S | I | A | P | D | G | D | Y | A | L | K | G | D | D | W | Q | V | M | S | F | T | F | K | A | M | Q | L | N | N | I | T | Q | R | V | Y | I | D | I | V | E | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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