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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6wmtB_ | 4.43 | PDB header: transcription | Chain: B: PDB Molecule: dna-directed rna polymerase subunit alpha 2; |
Added to library: Sat Nov 14 08:46:13 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | E | N | L | L | H | P | T | N | I | K | I | D | E | Y | A | K | N | A | T | K | F | S | F | E | A | L | E | R | G | V | G | Y | T | L | G | F | A | L | K | Q | T | M | L | Y | S | I | A | G | A | C | V | T | S | I | K | I | N | D | G | K | V | T | S | L | E | D | V | I | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | C | D | E | T | V | A | D | I | I | L | N | V | K | S | L | S | V | T | L | A | E | D | V | E | T | G | T | I | T | F | E | L | S | G | S | E | E | E | I | F | S | E | E | A | K | L | S | E | G | L | A | I | T | E | E | V | F | I | C | S | Y | N | G | G | K | K | L | K | I | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | B | S | S | T | T | S | S | T | T | B | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | K | V | E | K | G | V | G | F | R | P | A | Q | D | N | F | K | D | G | E | F | L | L | D | A | T | F | S | P | V | V | F | C | D | F | E | I | K | D | A | R | V | G | R | R | T | D | L | D | K | L | E | L | N | I | K | T | N | G | N | V | N | C | E | E | A | L | R | L | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | B | S | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | T | K | I | Q | N | Q | L | R | N | I | V | D | I | E | E | I | N | K | G | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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