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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6w1sD_ | 4.02 | PDB header: gene regulation | Chain: D: PDB Molecule: mediator of rna polymerase ii transcription subunit 7; |
Added to library: Sat Mar 13 08:46:08 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | P | P | P | M | Q | Y | I | K | E | Y | T | D | E | N | I | Q | E | G | L | A | P | K | P | P | P | P | I | K | D | S | Y | M | M | F | G | N | Q | F | Q | C | D | D | L | I | I | R | P | L | E | S | Q | G | I | E | R | L | H | P | M | Q | F | D | H | K | K | E | L | R | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | N | M | S | I | L | I | N | F | L | D | L | L | D | I | L | I | R | S | P | G | S | I | K | R | E | E | K | L | E | D | L | K | L | L | F | V | H | V | H | H | L | I | N | E | Y | R | P | H | Q | A | R | E | T | L | R | V | M | M | E | V | Q | K | R | Q | R | L | E | T | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | E | R | F | Q | K | H | L | E | R | V | I | E | M | I | Q | N | C | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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