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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6w1sC_ | 4.02 | PDB header: gene regulation | Chain: C: PDB Molecule: mediator of rna polymerase ii transcription subunit 6; |
Added to library: Sat Mar 13 08:31:09 2021 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | N | L | L | G | I | S | W | V | D | S | S | W | I | P | I | L | N | S | G | S | V | L | D | Y | F | S | E | R | S | N | P | F | Y | D | R | T | C | N | N | E | V | V | K | M | Q | R | L | T | L | E | H | L | N | Q | M | V | G | I | E | Y | I | L | L | H | A | Q | E | P | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | I | I | R | K | Q | Q | R | Q | S | P | A | Q | V | I | P | L | A | D | Y | Y | I | I | A | G | V | I | Y | Q | A | P | D | L | G | S | V | I | N | S | R | V | L | T | A | V | H | G | I | Q | S | A | F | D | E | A | M | S | Y | C | R | Y | H | P | S | T | V | S | T | K | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | B | S | S | S | S | B | S | B | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | P | E | K | R | M | R | L | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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