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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6vw9A_ | 1.80 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: k+/cl-cotransporter; |
Added to library: Sat Jul 18 08:36:49 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | N | W | R | P | Q | L | L | L | L | L | S | M | Q | W | S | K | E | I | I | D | V | R | Y | L | N | L | L | N | L | A | S | Q | L | K | A | G | K | G | L | T | V | V | T | A | F | L | Q | G | D | P | T | S | P | D | D | K | K | K | G | E | Q | V | K | A | R | M | D | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | M | N | Q | V | R | L | R | G | F | A | K | T | L | V | H | S | E | D | Q | V | R | G | S | M | S | T | L | V | Q | S | V | G | L | G | G | L | K | P | N | T | M | L | I | S | W | P | V | H | E | R | E | E | T | E | Y | N | T | F | I | E | K | V | H | A | A | S | I | N | D | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | I | V | V | A | K | G | I | I | D | F | P | S | A | V | F | R | M | S | G | M | I | D | V | Y | W | I | V | H | D | G | G | L | C | L | L | M | G | Y | L | L | K | Q | H | K | V | W | R | G | C | K | L | R | V | I | G | I | A | Q | E | S | D | N | N | V | K | M | Q | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | T | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | ||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | Q | K | Y | V | Y | Q | L | R | I | D | A | K | I | M | I | V | E | L | A | D | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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