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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6vfvA_ | 2.90 | PDB header: cell adhesion | Chain: A: PDB Molecule: protocadherin-8; |
Added to library: Sat Mar 14 08:54:24 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | N | D | N | A | P | L | F | T | R | P | V | Y | E | V | S | V | R | E | N | N | P | P | G | A | Y | L | A | T | V | A | A | R | D | R | D | L | G | R | N | G | Q | V | T | Y | R | L | L | E | A | E | V | G | R | A | G | G | A | V | S | T | Y | V | S | V | D | P | A | T | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | G | G | G | G | B | T | T | T | B | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | I | Y | A | L | R | S | F | D | Y | E | T | L | R | Q | L | D | V | R | I | Q | A | S | D | G | G | S | P | Q | L | S | S | S | A | L | V | Q | V | R | V | L | D | Q | N | D | H | A | P | V | L | V | H | P | A | P | A | N | G | S | L | E | V | A | V | P | G | R | T | A | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | B | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | T | V | V | A | R | V | Q | A | R | D | A | D | E | G | A | N | G | E | L | A | F | E | L | Q | Q | Q | E | P | R | E | A | F | A | I | G | R | R | T | G | E | I | L | L | T | G | D | L | S | Q | E | P | P | G | R | V | F | R | A | L | L | V | I | S | D | G | G | R | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | G | G | G | G | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | T | T | T | A | T | V | S | F | V | V | T | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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