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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6valH_ | 3.87 | PDB header: membrane protein | Chain: H: PDB Molecule: green fluorescent protein, calhm1,calmh2 chimera; |
Added to library: Sat Feb 1 08:19:27 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Y | S | A | F | D | F | N | C | P | C | L | P | R | Y | N | L | A | Y | G | L | G | V | L | L | V | P | P | L | I | L | F | L | L | G | F | V | L | N | N | N | V | S | M | L | A | E | E | W | R | R | K | D | A | A | V | L | R | Y | M | F | C | S | M | V | Q | R | A | M | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | P | A | V | W | V | S | V | T | L | L | D | G | K | C | I | T | C | A | F | C | T | S | L | P | V | E | A | L | P | Q | G | E | V | K | R | V | L | A | R | I | P | C | K | E | I | Y | D | G | Q | E | L | I | A | N | E | V | A | V | R | Y | L | R | C | I | S | Q | A | L | G | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | C | F | V | L | L | M | T | T | L | A | F | L | V | R | S | L | K | H | Y | C | S | P | L | S | Y | R | Q | E | A | Y | W | A | Q | Y | R | A | N | E | D | Q | L | F | Q | R | T | A | E | V | H | S | R | V | L | A | A | N | N | V | R | R | F | F | G | F | V | A | L | N | K | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | D | E | E | L | I | A | N | F | P | V | E | G | T | Q | P | R | P | Q | W | N | A | I | T | G | V | Y | L | Y | R | E | N | Q | G | L | P | L | Y | S | R | L | H | K | W | A | Q | G | L | |||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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