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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6v40D_ | 2.10 | PDB header: protein transport | Chain: D: PDB Molecule: pg_binding_3 domain-containing protein; |
Added to library: Sat Feb 1 08:26:20 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | H | H | S | S | G | L | V | P | R | G | S | T | K | D | E | I | F | A | A | I | L | S | R | E | G | G | Y | V | D | H | P | D | D | R | G | G | P | T | H | W | G | I | T | L | T | T | A | R | A | N | G | Y | M | G | D | M | R | N | L | T | R | N | Q | A | L | K | I | L | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T | B | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | Y | W | Y | G | P | R | L | D | Q | V | A | I | I | S | H | S | I | A | A | E | L | C | D | T | G | V | N | M | G | P | S | I | P | I | K | Y | F | Q | R | W | L | N | V | F | N | D | Q | Q | K | I | Y | P | D | L | I | A | D | G | Q | I | G | P | R | T | L | S | A | L | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | ||||
Sequence | F | F | L | S | H | R | R | D | E | G | E | M | I | L | I | R | A | L | N | C | S | Q | G | Q | R | Y | L | E | L | A | E | K | R | Q | A | N | E | S | F | V | Y | G | W | I | K | E | R | V | R | L | ||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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