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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6u8yM_ | 4.00 | PDB header: membrane protein | Chain: M: PDB Molecule: nadh dehydrogenase subunit; |
Added to library: Sat Sep 12 08:44:24 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | G | V | F | L | R | A | L | L | I | I | I | Y | A | T | F | V | G | F | I | F | M | G | I | I | R | K | V | T | A | R | I | H | R | R | I | G | P | P | I | Y | Q | P | I | I | D | T | L | K | F | F | G | K | K | E | N | I | T | H | G | L | I | Y | D | F | G | I | I | Y | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | V | G | A | T | I | L | A | L | M | F | I | P | L | G | P | I | S | V | L | R | A | Y | G | D | L | I | L | V | T | F | L | L | E | I | P | M | L | G | I | M | F | A | A | M | S | S | G | N | P | Y | A | G | I | G | A | Q | R | A | L | L | T | L | L | A | I | Q | V | P | L | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | A | I | I | A | V | A | E | Y | Y | G | T | F | S | T | Y | E | I | V | M | A | Q | Q | K | M | G | W | S | I | F | H | L | P | L | L | L | A | A | I | A | Y | D | I | V | L | Q | A | M | F | G | K | E | P | F | D | I | M | I | A | P | G | E | I | S | L | G | P | M | V | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S | T | G | G | G | G | G | G | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | F | G | G | K | H | M | G | M | L | Q | I | Q | H | A | M | A | L | F | A | E | T | L | F | F | S | N | I | F | L | G | G | G | V | P | L | L | N | T | L | A | S | L | A | V | L | L | V | K | Q | I | A | V | L | L | I | A | I | F | V | G | A | I | F | P | R | F | T | I | D | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | A | A | K | F | Y | W | K | W | P | T | I | I | A | A | I | G | A | I | M | A | S | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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