|
| |||||
  | Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.0 |
  |
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6tydV_ | 2.80 | PDB header: transcription | Chain: V: PDB Molecule: lim domain-binding protein 1; |
Added to library: Sat Jan 4 08:15:53 2020 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | G | N | Q | T | D | Y | R | I | F | E | L | N | K | R | L | Q | N | W | T | E | E | C | D | N | L | W | W | D | A | F | T | T | E | F | F | E | D | D | A | X | L | T | I | T | F | C | L | E | D | G | P | K | R | Y | T | I | G | R | T | L | I | P | R | Y | F | R | S | I | F | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | G | A | T | E | L | Y | Y | V | L | K | H | P | K | E | A | F | H | S | N | F | V | S | L | D | C | D | Q | G | S | X | V | T | Q | H | G | K | P | X | F | T | Q | V | C | V | E | G | R | L | Y | L | E | F | X | F | D | D | X | X | R | I | K | T | W | H | F | S | I | R | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | H | R | E | L | I | P | R | S | I | L | A | X | H | A | Q | D | P | Q | X | L | D | Q | L | S | K | N | I | T | R | C | G | L | S | N | S | T | L | N | Y | L | R | L | C | V | I | L | E | P | X | Q | E | L | X | S | R | H | K | T | Y | S | L | S | P | R | D | C | L | K | T | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | G | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | F | Q | K | W | Q | R | X | V | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|