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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6tc9C_ | 2.18 | PDB header: dna binding protein | Chain: C: PDB Molecule: formamidopyrimidine-dna glycosylase; |
Added to library: Sat Sep 19 09:37:43 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | E | L | P | E | V | E | T | T | L | R | G | I | A | P | H | I | E | G | K | T | V | E | A | V | V | L | R | Q | L | K | L | R | W | Q | I | N | P | D | L | G | E | I | L | S | G | R | Q | V | L | S | C | G | R | R | A | K | Y | L | L | I | R | F | Q | T | G | V | L | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | B | S | S | S | B | T | T | T | T | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | H | L | G | M | S | G | S | L | R | I | F | T | P | S | D | G | R | I | G | R | P | D | R | H | D | H | V | D | I | V | F | S | D | G | T | V | M | R | Y | R | D | P | R | K | F | G | A | I | L | W | Y | E | E | E | H | H | P | L | L | E | K | L | G | P | E | P | L | S | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | G | G | G | G | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | C | A | D | Y | L | Y | A | R | L | K | A | Q | K | R | A | V | K | L | A | L | M | D | N | A | V | V | V | G | V | G | N | I | Y | A | N | E | S | L | F | R | A | G | I | S | P | H | R | P | A | N | R | L | K | K | K | E | C | A | L | L | V | E | T | V | K | A | V | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | S | B | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | S | B | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | R | A | I | E | T | G | S | G | Y | F | Q | Q | E | Y | T | V | Y | G | R | H | N | Q | P | C | P | R | C | G | G | L | V | V | K | E | T | L | G | Q | R | G | T | F | Y | C | P | N | C | Q | K | |||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | S | B | T | T | T | B | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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