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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6tb4K_ | 3.80 | PDB header: transcription | Chain: K: PDB Molecule: subunit (61/68 kda) of tfiid and saga complexes; |
Added to library: Sat Feb 1 08:24:06 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | T | L | I | N | Q | H | I | L | K | P | A | P | P | P | T | E | I | P | A | R | L | Q | V | K | P | P | Q | P | A | A | M | K | I | P | N | R | P | T | L | L | G | G | S | A | I | S | Q | P | S | L | K | E | L | L | R | N | V | G | A | D | E | G | D | G | E | T | V | I | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | V | E | E | L | L | L | D | L | A | D | E | F | V | T | S | V | T | S | F | A | C | R | L | A | K | H | R | K | V | D | N | I | D | M | R | D | V | Q | L | H | L | E | R | N | W | N | I | R | V | P | G | Y | A | S | D | E | I | R | S | V | R | K | F | Q | P | T | A | G | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | S | S | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | N | Q | K | V | Q | G | V | A | I | S | K | S | V | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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