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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6tb4F_ | 3.80 | PDB header: transcription | Chain: F: PDB Molecule: spt20; |
Added to library: Sat Feb 1 08:23:21 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | F | A | E | T | S | E | E | I | L | H | K | Y | E | K | F | P | P | S | L | T | F | H | I | H | E | N | H | Y | R | F | G | D | Q | D | G | V | I | P | K | N | S | S | V | I | K | A | F | L | E | Y | V | A | R | E | E | I | P | P | A | L | I | E | V | T | K | D | A | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | T | T | T | B | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Q | L | Y | E | G | C | I | I | L | R | I | Y | D | H | R | K | T | Y | T | T | I | L | R | P | T | Q | L | S | L | Y | A | D | L | L | Y | Q | T | D | Y | L | Q | V | R | F | T | D | S | L | S | L | N | I | E | T | E | I | L | T | A | S | K | R | N | L | D | L | S | V | P | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | N | P | H | R | A | T | A | N | L | K | P | E | V | K | Y | P | Y | Y | D | P | E | T | D | T | V | V | H | E | H | R | P | D | A | R | G | N | M | V | N | A | D | T | V | D | S | D | Y | E | R | L | M | L | L | L | S | D | R | F | M | R | L | R | F | V | E | A | W | R | K | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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