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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6tarD_ | 2.80 | PDB header: virus like particle | Chain: D: PDB Molecule: activity-regulated cytoskeleton associated protein 1; |
Added to library: Sat Jan 4 08:14:34 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | G | N | F | S | A | C | T | H | S | F | G | G | T | R | D | H | D | V | V | E | E | F | I | G | N | I | E | T | Y | K | D | V | E | G | I | S | D | E | N | A | L | K | G | I | S | L | L | F | Y | G | M | A | S | T | W | W | Q | G | V | R | K | E | A | T | T | W | K | E | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | S | S | T | G | G | G | S | B | T | G | G | G | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | A | L | I | R | E | H | F | S | P | T | K | P | A | Y | Q | I | Y | M | E | F | F | Q | N | K | Q | D | D | H | D | P | I | D | T | F | V | I | Q | K | R | A | L | L | A | Q | L | P | S | G | R | H | D | E | E | T | E | L | D | L | L | F | G | L | L | N | I | K | Y | R | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | H | I | S | R | H | S | V | H | T | F | K | D | L | L | E | Q | G | R | I | I | E | H | N | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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