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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6t3tA_ | 2.10 | PDB header: lyase | Chain: A: PDB Molecule: 4-hydroxy-tetrahydrodipicolinate synthase; |
Added to library: Sat May 9 08:23:18 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | I | Q | G | T | Y | T | A | I | I | S | P | F | H | N | G | Q | I | D | R | K | A | L | E | R | L | L | E | H | Q | I | E | N | R | I | D | G | I | V | P | V | G | T | T | G | E | S | P | T | L | S | Y | E | E | H | I | E | L | V | R | L | T | A | E | I | V | E | K | R | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | I | F | A | G | T | G | S | N | S | T | A | E | A | I | H | L | T | K | E | A | E | K | I | G | V | D | G | V | L | L | V | S | P | Y | Y | N | R | P | S | Q | E | G | L | F | R | H | F | S | A | I | A | A | S | T | S | L | P | I | L | L | Y | N | I | P | S | R | C | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | D | I | A | V | D | T | V | K | R | L | V | E | K | N | K | N | I | V | G | I | K | E | A | G | G | S | V | D | R | V | S | Q | L | V | E | A | L | P | G | E | F | S | I | L | S | G | D | D | A | L | T | L | P | F | L | S | V | G | A | V | G | V | V | S | V | A | S | N | L | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | T | T | S | G | G | G | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | P | R | P | V | S | A | L | V | R | L | Y | L | E | G | K | P | F | E | A | R | Q | L | H | Q | T | L | Y | P | L | F | R | D | L | M | I | E | T | N | P | V | P | V | K | T | A | L | A | M | E | G | L | T | D | L | E | L | R | L | P | L | A | P | L | Q | P | Q | N | L | E | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | K | T | T | L | S | R | T | K | E | K | L | A | K | V | E | H | L | W | A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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