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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6smhO_ | 4.30 | PDB header: photosynthesis | Chain: O: PDB Molecule: rubisco accumulation factor 1 (raf1) peptide; |
Added to library: Sat Jul 11 08:29:31 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | R | Q | E | L | L | G | Q | L | R | R | K | E | G | R | W | L | A | W | A | R | A | C | Q | T | L | L | K | N | G | L | N | P | Q | T | L | F | E | A | T | G | F | E | P | I | Q | Q | N | Q | I | T | V | A | M | Q | V | Y | D | S | I | L | R | Q | D | P | P | A | H | V | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | T | Y | Q | E | W | G | S | D | L | L | Y | E | L | R | E | L | D | Q | E | Q | R | S | L | C | A | Q | L | A | L | E | R | K | L | D | A | D | Q | I | R | E | V | A | K | A | T | K | D | F | C | R | L | P | K | Q | P | E | N | F | D | R | H | P | G | D | A | V | A | H | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | T | T | G | G | G | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . |
Sequence | C | W | R | L | A | Q | E | R | T | D | L | T | E | R | S | R | L | I | A | R | G | L | Q | F | A | Q | S | A | G | A | R | A | L | I | E | A | L | L | L | D | L | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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