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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6sicH_ | 3.52 | PDB header: antiviral protein | Chain: H: PDB Molecule: crispr-associated protein, cmr3 family; |
Added to library: Sat Jul 11 08:34:44 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | K | R | V | L | I | K | P | L | E | P | L | M | F | R | S | Q | G | E | F | E | P | L | I | T | G | S | H | T | A | A | Q | S | L | I | I | P | R | P | S | T | I | A | G | M | L | G | Y | I | L | F | N | K | S | S | G | T | G | D | W | L | S | D | L | T | N | L | L | A | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | B | S | S | S | S | B | B | S | S | S | S | T | T | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | G | T | F | I | E | T | N | G | E | Y | L | F | P | L | R | M | G | N | H | L | A | L | V | D | Q | Q | H | L | I | N | L | P | T | L | L | E | K | E | Y | E | R | R | E | K | G | I | Y | E | L | F | Y | D | K | N | K | L | F | Q | I | I | N | H | Q | D | R | I | G | I | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | B | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | D | K | S | T | R | T | V | K | E | H | Y | L | Y | S | A | R | Y | L | A | F | K | K | E | V | N | Y | V | I | F | I | D | N | D | A | I | S | D | K | I | N | G | K | I | V | N | F | G | G | E | N | R | I | A | K | L | E | V | D | D | Y | K | V | D | T | S | I | E | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | B | S | S | S | T | T | S | S | S | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Y | Y | L | A | L | S | P | I | L | I | P | D | E | A | L | D | N | F | L | D | N | I | S | D | Y | V | A | M | G | K | V | D | K | I | S | L | G | F | D | I | A | N | T | K | R | K | E | M | L | T | A | I | L | E | G | S | I | V | K | R | S | I | I | D | F | I | K | N | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | T | B | T | T | T | S | B | T | T | G | G | G | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | |||||||||||
Sequence | K | N | D | L | R | Y | R | F | S | K | Y | E | K | I | G | Y | N | T | L | M | S | L | C | K | L | A | L | R | K | I | L | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S |
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