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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6shlC_ | 3.10 | PDB header: virus | Chain: C: PDB Molecule: vp3; |
Added to library: Sat Feb 15 08:31:20 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | R | P | A | V | L | S | D | I | Q | P | Y | V | P | R | Y | C | G | N | L | A | N | S | D | A | P | E | T | V | N | K | L | S | V | D | S | K | N | E | L | I | D | T | R | T | M | G | L | G | G | A | D | E | L | T | I | H | S | I | A | S | R | M | T | F | W | R | Q | F | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | S | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | P | E | S | A | V | T | D | T | L | L | A | S | M | S | V | Q | P | F | C | I | D | T | V | T | A | S | P | V | T | E | I | H | S | T | A | L | A | F | A | S | A | P | F | E | T | W | Q | G | S | I | K | F | H | F | K | V | V | C | S | E | Y | H | R | G | R | L | R | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | N | P | L | T | N | N | A | G | P | V | A | F | N | Q | V | Y | S | T | T | I | D | I | S | N | D | R | E | F | D | Y | E | C | K | W | T | D | I | R | A | W | N | A | C | I | G | I | D | G | A | T | S | A | T | F | F | N | T | A | A | A | V | T | G | G | T | P | F | D | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | S | B | B | T | T | T | S | S | S | S | T | S | S | S | B | S | S | S | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . |
Sequence | G | T | L | S | V | Y | V | V | N | E | L | A | T | P | S | T | A | A | A | D | V | K | V | Q | V | W | V | S | A | G | D | D | F | A | V | A | V | P | G | V | G | L | S | Q | L | S | Y | F | Q | Q | Q | |||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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