| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6r99A_ | 2.70 | PDB header: unknown function | Chain: A: PDB Molecule: ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5; |
Added to library: Sat Apr 25 08:25:18 2020 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | R | R | H | W | P | V | P | Y | K | R | F | D | F | R | P | K | P | D | P | Y | C | Q | A | K | Y | T | F | C | P | T | G | S | P | I | P | V | X | E | G | D | D | D | I | E | V | F | R | L | Q | A | P | V | H | L | K | I | X | H | D | A | I | G | F | R | S | T | L | T | G | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | N | Y | T | X | E | W | Y | E | L | F | Q | L | G | N | C | T | F | P | H | L | R | P | E | X | D | A | P | F | W | C | N | Q | G | A | A | C | F | F | E | G | I | D | D | V | H | W | K | E | N | G | T | L | V | Q | V | A | T | I | S | G | N | X | F | N | Q | X | A | K | W | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | B | T | T | S | S | B | B | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | Q | D | N | E | T | G | I | Y | Y | E | T | W | N | V | K | A | S | P | E | K | G | A | E | T | W | F | D | S | Y | D | C | S | K | F | V | L | R | T | F | N | K | L | A | E | F | G | A | E | F | K | N | I | E | T | N | Y | T | R | I | F | L | Y | S | G | E | P | T | Y | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | B | S | S | S | T | T | B | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | G | N | E | T | S | V | F | G | P | T | G | N | K | T | L | G | L | A | I | K | R | F | Y | Y | P | F | K | P | F | L | L | S | L | L | Q | I | F | D | A | V | I | V | H | K | Q | F | Y | L | F | Y | N | F | E | Y | W | F | L | P | X | K | F | P | F | I | K | I | T | Y | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | G | G | G | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | I | P | L | P | I | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|