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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6r6kB_ | 2.10 | PDB header: protein transport | Chain: B: PDB Molecule: abc transporter substrate-binding protein; |
Added to library: Sat Aug 3 08:20:17 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | R | I | G | I | T | L | H | P | Y | Y | S | Y | V | S | N | I | V | G | D | K | A | E | V | V | P | L | I | P | A | G | F | N | P | G | A | Y | E | P | R | A | E | D | I | K | R | I | G | T | L | D | V | V | V | L | N | G | V | G | G | D | D | F | A | E | R | M | I | A | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | T | T | S | S | S | G | G | G | G | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | E | K | P | G | I | P | V | I | E | A | N | A | K | V | P | L | L | A | A | T | G | M | A | A | R | G | A | G | K | V | V | N | P | G | T | F | L | S | I | S | A | S | I | T | Q | V | N | T | I | A | R | E | L | G | K | L | D | P | A | N | A | K | A | Y | T | R | N | A | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | T | T | B | S | T | T | T | B | G | G | G | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | Y | A | K | R | L | R | A | L | R | A | D | A | L | A | R | L | N | K | A | P | A | A | D | F | R | V | A | T | I | G | G | A | Y | D | Y | L | L | R | E | F | G | L | E | V | T | A | V | V | E | P | A | G | G | I | E | P | S | P | S | Q | L | K | K | T | I | D | Q | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | G | S | S | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . |
Sequence | A | L | D | V | K | V | I | F | S | E | I | D | F | P | S | T | Y | V | E | T | I | Q | R | E | S | G | V | K | L | Y | S | L | S | G | I | S | Y | G | D | Y | S | A | G | K | Y | E | E | E | M | A | R | N | L | D | T | V | V | R | A | I | Q | E | S | |||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S |
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