| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6qph4_ | 3.40 | PDB header: photosynthesis | Chain: 4: PDB Molecule: lhc4; |
Added to library: Sat Feb 15 09:26:09 2020 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | D | R | P | L | W | Y | P | G | A | T | P | P | A | H | L | D | G | S | M | L | G | D | Y | G | F | D | P | L | R | L | G | T | N | P | D | R | M | K | W | F | R | E | A | E | L | T | N | G | R | W | A | M | A | A | V | V | G | I | L | F | T | D | V | F | T | S | I | G | L | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | L | P | K | W | W | E | A | G | A | Q | T | Y | P | I | D | N | Q | T | L | R | T | L | A | I | I | E | F | L | L | F | G | W | V | E | T | K | R | L | Y | D | L | R | N | P | G | S | Q | G | D | G | S | F | L | G | I | T | D | G | L | K | G | T | E | N | G | Y | P | G | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | G | G | G | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | F | D | P | L | G | Y | S | K | T | S | P | E | K | L | D | E | L | Q | N | G | R | L | A | M | L | A | F | L | G | F | A | S | T | A | A | V | N | G | Q | G | P | I | E | S | L | Q | T | H | L | A | D | P | F | H | V | T | F | A | T | N | G | V | S | I | P | H | F | T | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | T | S | S | G | G | G | T | T | S | S | G | G | G |   | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|