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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6pnjL_ | 3.20 | PDB header: photosynthesis | Chain: L: PDB Molecule: photosystem i reaction center protein subunit xi; |
Added to library: Sat Feb 15 08:28:09 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | I | I | K | P | F | K | G | D | P | C | L | G | N | L | S | T | P | I | N | D | S | P | L | A | K | A | F | I | N | N | L | P | A | Y | R | K | G | L | T | P | F | M | R | G | L | E | I | G | M | A | H | G | Y | F | L | V | G | P | E | V | V | I | G | P | L | R | E | S | A | H |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | T | T | S | S | T | T | T | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | A | N | L | S | G | L | I | T | A | I | Y | I | A | V | S | A | C | L | G | I | S | I | F | A | I | T | T | F | Q | G | N | P | K | G | S | Y | D | S | L | R | P | L | R | T | R | E | E | W | S | Q | L | N | G | G | I | F | L | G | A | M | G | G | A | I | F | A | Y | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | E | N | F | D | A | L | D | A | I | L | R | G | A | V | N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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