| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6p2iA_ | 1.63 | PDB header: oxidoreductase, biosynthetic protein | Chain: A: PDB Molecule: glycerate dehydrogenase; |
Added to library: Sat Jul 27 08:35:26 2019 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | M | K | I | T | Y | I | D | K | P | T | Y | L | P | S | W | V | I | N | K | I | N | E | Y | G | D | F | E | V | F | Y | D | F | P | N | E | E | E | A | I | N | R | L | S | S | T | D | I | A | I | V | E | W | T | S | I | T | K | E | M | I | E | K | I | S | R | L | K | Y | L | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | S | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | I | T | T | S | Y | D | Y | I | D | V | N | S | L | K | D | N | E | I | M | V | S | N | C | P | Q | Y | S | K | Q | A | V | A | E | H | V | F | A | L | L | F | A | V | N | R | K | I | L | Q | A | D | E | T | C | R | K | G | L | S | H | I | Y | P | P | F | L | C | S | E | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | B | T | T | S | T | T | T | T | T | T | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | D | K | T | I | G | L | I | G | I | G | Q | I | G | Q | T | V | A | E | I | A | N | A | F | Q | M | K | V | I | G | L | N | K | S | K | R | N | V | K | G | I | Q | Q | V | D | I | T | E | L | M | K | K | S | D | I | I | S | L | H | I | P | R | N | A | D | T | E | I | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | T | E | K | L | L | S | L | M | K | P | D | A | V | L | I | N | T | C | R | G | N | L | I | D | E | Q | A | L | Y | S | V | L | K | Q | N | R | I | R | G | A | G | L | D | D | L | T | Y | Y | K | D | N | P | I | I | G | L | N | N | V | V | L | T | P | G | S | A | W | Y | S | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | G | G | G | B | T | T | S | S | S | S | T | T | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||
Sequence | E | A | R | E | K | N | M | Y | E | L | I | E | N | I | E | S | Y | L | A | Q | K | P | V | N | V | I | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|