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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6orkA_ | 3.00 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: sel1 repeat protein; |
Added to library: Sat May 9 08:29:32 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | N | V | E | E | G | N | H | L | Y | N | A | G | K | Y | Q | E | A | L | T | F | F | X | K | P | D | A | V | N | N | P | A | T | X | N | R | I | G | Y | X | Y | D | E | G | Q | G | V | K | K | D | P | K | E | A | F | K | W | Y | K | K | A | A | D | A | N | L | P | V | A | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | N | L | G | L | X | Y | Q | H | G | T | G | V | S | K | D | I | N | E | S | I | K | W | F | R | K | A | A | E | Q | N | D | P | D | A | E | X | K | X | G | Y | L | T | A | T | G | T | G | V | K | K | D | Y | Q | E | A | I | Q | W | Y | Q | R | A | A | E | H | G | D | S | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | T | T | T | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | A | Y | A | Q | I | G | L | F | Y | T | L | G | N | G | V | K | K | D | V | N | R | A | V | Q | Y | Y | I | X | G | A | Q | K | G | D | A | R | A | Q | A | F | L | G | K | A | Y | A | L | G | R | G | I | Q | P | D | S | E | K | A | L | Y | W | Y | K | T | A | A | R | N | G | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | T | T | T | T | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | V | N | A | X | K | E | L | G | S | I | Y | A | K | G | R | L | G | V | K | P | D | Q | Q | E | A | Q | R | W | N | D | X | A | R | K | A | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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