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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6op8A_ | 1.70 | PDB header: ligase/protein binding | Chain: A: PDB Molecule: ubiquitin-conjugating enzyme e2-18 kda; |
Added to library: Sat Aug 10 08:23:08 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | M | A | L | R | R | L | M | K | E | Y | K | E | L | T | E | N | G | P | D | G | I | T | A | G | P | S | N | E | D | D | F | F | T | W | D | C | L | I | Q | G | P | D | G | T | P | F | E | G | G | L | Y | P | A | T | L | K | F | P | S | D | Y | P | L | G | P | P | T | L | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | T | T | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | F | E | C | E | F | F | H | P | N | V | Y | K | D | G | T | V | C | I | S | I | L | H | A | P | G | D | D | P | N | M | Y | E | S | S | S | E | R | W | S | P | V | Q | S | V | E | K | I | L | L | S | V | M | S | M | L | A | E | P | N | D | E | S | G | A | N | I | D | A | C | K |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | B | T | T | S | B | B | G | G | G | S | T | T | S | S | T | T | T | S | T | T | S | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||
Sequence | M | W | R | E | D | R | E | E | Y | C | R | V | V | R | R | L | A | R | K | T | L | G | L | L | V | P | R | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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