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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6oj1A_ | 1.76 | PDB header: hydrolase | Chain: A: PDB Molecule: endo alpha-1,4 polygalactosaminidase; |
Added to library: Sat Aug 17 08:22:13 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | N | Y | T | T | A | K | W | Q | P | A | V | G | T | K | W | Q | I | E | L | L | Y | A | L | N | D | T | S | V | D | A | E | I | Y | D | I | D | L | F | I | N | D | K | S | T | I | A | G | L | Q | R | A | G | R | K | V | I | C | Y | F | S | A | G | S | Y | E | N | W | R | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T | S | S | T | T | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | K | D | K | F | K | D | S | D | L | G | H | D | L | D | D | W | P | G | E | K | W | L | N | I | S | S | A | N | V | R | Q | I | M | L | D | R | L | D | M | A | R | D | K | G | C | D | G | V | D | P | D | N | V | D | G | Y | D | N | D | N | G | L | D | L | T | Q | A | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | G | G | G | G | G | G | S | S | S | T | T | T | T | T | S | G | G | G | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | S | F | V | N | F | L | A | N | A | A | H | A | R | N | M | S | I | G | L | K | N | A | G | D | I | I | P | S | V | I | K | N | M | Q | W | S | V | N | E | Q | C | A | Q | Y | N | E | C | D | T | Y | A | V | F | P | Q | N | G | K | P | V | F | H | I | E | Y | P | K | G | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | G | G | G | S | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | ||||||
Sequence | K | T | N | N | D | L | S | V | T | A | S | Q | K | N | A | A | C | D | F | A | G | S | A | N | F | S | T | V | I | K | N | M | N | L | N | N | W | V | E | Y | C | |||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | G | G | G | T | T | S |
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