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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6oitE_ | 3.50 | PDB header: plant protein | Chain: E: PDB Molecule: protein defective in meristem silencing 3; |
Added to library: Sat Jul 27 08:27:59 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | E | F | A | M | F | N | S | K | R | L | E | S | D | L | E | A | M | G | N | K | I | K | Q | H | E | D | N | L | K | F | L | K | S | Q | K | N | K | M | D | E | A | I | V | D | L | Q | V | H | M | S | K | L | E | D | I | N | A | Q | I | L | R | H | E | N | S | A | A | G | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | S | L | V | E | T | L | L | M | L | T | K | G | V | V | G | V | V | A | K | L | G | K | V | N | D | E | N | L | S | Q | I | L | S | N | Y | L | G | T | R | S | M | L | A | V | V | C | R | N | Y | E | S | V | T | A | L | E | A | Y | D | N | H | G | N | I | D | I | N | A | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | T | T | T | T | S | S | T | T | T | S | S | S | S | B | S | S | S | S | B | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | H | C | L | G | S | S | I | G | R | E | I | G | D | S | F | D | A | I | C | L | E | N | L | R | P | Y | V | G | Q | H | I | A | D | D | L | Q | R | R | L | D | L | L | K | P | K | L | P | N | G | E | C | P | P | G | F | L | G | F | A | V | N | M | I | Q | I | D | P | A | Y |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | T | T | T | S | S | B | T | T | S | S | B | S | S | S | S | T | T | S | S | T | T | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | L | L | C | V | T | S | Y | G | Y | G | L | R | E | T | L | F | Y | N | L | F | S | R | L | Q | V | Y | K | T | R | A | D | M | I | S | A | L | P | C | I | S | D | G | A | V | S | L | D | G | G | I | I | R | K | T | G | I | F | N | L | G | N | R | D | E | V | N | V | R | F | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | G | G | G | S | T | T | S | S | S | S | S | S | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 300 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 310 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 320 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 330 | . | . | . | . | . | . |
Sequence | K | P | T | A | S | R | T | M | D | N | Y | S | E | A | E | K | K | M | K | E | L | K | W | K | K | E | K | T | L | E | D | I | K | R | E | Q | V | L | R | E | H | A | V | F | N | F | G | K | K | K | E | E | F | V | R | C | ||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
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