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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6oijR_ | 3.30 | PDB header: signaling protein | Chain: R: PDB Molecule: muscarinic acetylcholine receptor m1; |
Added to library: Sat May 11 09:10:48 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | W | Q | V | A | F | I | G | I | T | T | G | L | L | S | L | A | T | V | T | G | N | L | L | V | L | I | S | F | K | V | N | T | E | L | K | T | V | N | N | Y | F | L | L | S | L | A | C | A | D | L | I | I | G | T | F | S | M | N | L | Y | T | T | Y | L | L | M | G | H | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | L | G | T | L | A | C | D | L | W | L | A | L | D | Y | V | A | S | Q | A | S | V | M | N | L | L | L | I | S | F | D | R | Y | F | S | V | T | R | P | L | S | Y | R | A | K | R | T | P | R | R | A | A | L | M | I | G | L | A | W | L | V | S | F | V | L | W | A | P | A | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | L | F | W | Q | Y | L | V | G | E | R | T | V | L | A | G | Q | C | Y | I | Q | F | L | S | Q | P | I | I | T | F | G | T | A | M | A | A | F | Y | L | P | V | T | V | M | C | T | L | Y | W | R | I | Y | R | E | T | E | N | R | A | R | E | L | A | A | L | Q | G | E | K | K | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | G | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | A | R | T | L | S | A | I | L | L | A | F | I | L | T | W | T | P | Y | N | I | M | V | L | V | S | T | F | C | K | D | C | V | P | E | T | L | W | E | L | G | Y | W | L | C | Y | V | N | S | T | I | N | P | M | C | Y | A | L | C | N | K | A | F | R | D | T | F | R | L | L | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | L | C | R | W | D | K | R | R | W | R | K | I | P | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | S |
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