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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6oeiA_ | 2.58 | PDB header: structural protein | Chain: A: PDB Molecule: spindle pole body component spc42,sigma-54-dependent |
Added to library: Sat Apr 27 08:30:32 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | F | I | N | K | A | V | Q | Q | N | K | E | L | N | F | K | L | R | E | K | Q | N | E | I | F | E | L | K | K | I | A | E | T | L | R | S | K | L | E | K | Y | V | D | I | T | K | K | L | E | D | Q | N | L | N | L | Q | I | K | I | S | D | L | E | K | K | L | S | D | A | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | S | A | L | K | L | X | Q | Y | I | G | D | A | I | G | T | I | R | D | P | Q | E | L | F | R | T | V | T | D | K | L | R | L | L | F | A | F | D | S | A | V | I | I | T | I | D | R | E | R | R | E | A | S | V | F | F | E | X | L | R | F | E | L | P | E | Q | L | R | H | Q | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | G | G | G | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | R | S | I | A | G | T | W | L | E | G | H | L | D | D | R | T | V | T | V | A | S | I | A | R | D | I | P | S | F | G | A | D | G | A | P | L | L | W | T | L | H | E | L | G | X | R | Q | I | V | L | S | P | L | R | S | G | G | R | V | I | G | F | L | S | F | V | S | A | E | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | S | G | G | G | G | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | ||||||||||
Sequence | K | L | W | S | D | G | D | K | S | L | L | S | G | V | S | S | S | I | A | I | A | V | S | N | A | L | A | Y | E | A | L | R | Q | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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