| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6nt6A_ | 4.00 | PDB header: immune system | Chain: A: PDB Molecule: stimulator of interferon genes protein; |
Added to library: Sat Mar 9 08:17:36 2019 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | P | A | R | L | L | I | P | E | P | R | A | G | R | A | R | H | A | A | C | V | L | L | A | V | C | F | V | V | L | F | L | A | P | I | I | R | S | V | C | T | Q | L | A | A | L | Q | L | G | V | L | L | K | G | C | C | C | L | A | E | E | I | F | H | L | H | S | R | H | H | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | Q | V | L | C | S | C | F | P | P | R | W | Y | L | A | L | L | L | V | G | G | S | A | Y | L | T | L | S | C | L | C | Q | L | L | V | L | A | L | G | L | Q | K | L | S | A | V | E | V | S | E | L | T | E | S | S | K | K | N | V | A | H | G | L | A | W | S | Y | Y | I | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | Y | L | K | V | V | L | P | R | L | K | E | C | M | E | E | L | S | W | K | L | H | I | L | V | P | L | G | C | D | I | W | D | D | L | E | K | A | D | S | N | I | Q | Y | L | A | D | L | P | Y | K | H | S | L | Y | V | I | R | L | R | P | C | V | L | E | F | A | S | P | L | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . |
Sequence | T | L | C | A | M | S | Q | D | D | C | A | A | F | S | R | E | Q | R | L | E | Q | A | R | L | F | Y | R | S | L | R | D | I | L | G | S | S | K | E | C | A | G | L | Y | R | L | I | A | Y | E | E | F | L | S | G | L | I | L | W | H | L | Q | Q | Q | Q | R | E | E | Y | ||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | S | T | T | S | S | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|