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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6nmiF_ | 3.70 | PDB header: transcription | Chain: F: PDB Molecule: general transcription factor iih subunit 3, p34; |
Added to library: Sat Mar 16 08:33:31 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | L | N | L | L | V | I | V | V | D | A | N | P | I | W | W | G | K | Q | A | L | K | E | S | Q | F | T | L | S | K | C | I | D | A | V | M | V | L | G | N | S | H | L | F | M | N | R | S | N | K | L | A | V | I | A | S | H | I | Q | E | S | R | F | L | Y | P | G | S | K | D | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | K | Y | E | L | L | T | S | A | N | E | V | I | V | E | E | I | K | D | L | M | T | K | S | D | I | K | G | Q | H | T | E | T | L | L | A | G | S | L | A | K | A | L | C | Y | I | H | R | M | N | K | E | V | K | D | N | Q | E | M | K | S | R | I | L | V | I | K | A | A | E | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | S | S | S | S | S | S | S | S | - | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | A | L | Q | Y | M | N | F | M | N | V | I | F | A | A | Q | K | Q | N | I | L | I | D | A | C | V | L | D | S | D | S | G | L | L | Q | Q | A | C | D | I | T | G | G | L | Y | L | K | V | P | Q | M | P | S | L | L | Q | Y | L | L | W | V | F | L | P | D | Q | D | Q | R | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T | S | S | S | S | S | S | G | G | G | T | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . |
Sequence | Q | L | I | L | P | P | P | V | H | V | D | Y | R | A | A | C | F | C | H | R | N | L | I | E | I | G | Y | V | C | S | V | C | L | S | I | F | C | N | F | S | P | I | C | T | T | C | E | T | A | F | K | I | S | |||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | B | S | S | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | T | T | T | T | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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