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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6mn7H_ | 4.80 | PDB header: viral protein | Chain: H: PDB Molecule: bf520.1 fab variable region; |
Added to library: Sat Mar 9 08:59:28 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | Q | V | Q | L | V | Q | S | G | A | E | M | K | M | P | G | A | S | V | K | V | S | C | K | A | S | G | Y | T | F | T | G | N | Y | I | H | W | V | R | Q | A | P | G | Q | G | L | E | W | M | G | W | I | A | P | H | S | G | D | T | S | Y | A | Q | R | F | Q | G | R | V | T | M |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | G | D | T | S | L | S | T | A | Y | M | E | L | S | R | L | R | S | D | D | T | A | V | Y | Y | C | A | R | G | P | F | P | N | Y | Y | G | P | G | S | Y | W | G | G | L | D | F | W | G | Q | G | T | L | V | S | V | S | S | E | I | V | M | T | Q | S | P | A | T | L | S | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | S | G | G | G | T | T | T | T | T | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | L | G | E | R | A | T | L | S | C | R | T | S | Q | N | V | A | Y | N | F | A | W | Y | Q | Q | K | P | G | Q | A | P | R | L | L | I | Y | E | A | S | S | R | A | T | G | T | P | A | R | F | S | G | S | G | F | G | T | E | F | T | L | T | I | S | S | M | Q | S | E | D | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | S | S | G | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||
Sequence | A | V | Y | Y | C | Q | Q | Y | N | N | W | P | S | P | F | T | F | G | P | G | T | K | V | H | I | K | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T |
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