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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6lbtA_ | 2.60 | PDB header: dna binding protein | Chain: A: PDB Molecule: klla0f20922p,klla0f20922p; |
Added to library: Sat Jul 18 08:45:12 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | L | K | P | D | S | I | S | K | A | I | T | D | R | L | Y | H | I | S | D | G | K | I | L | G | F | I | P | N | Q | Y | L | D | P | E | S | S | L | I | E | D | D | F | L | L | I | Y | V | Y | T | Y | E | L | P | L | L | S | A | V | F | V | P | E | Y | N | C | Y | E | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | T | S | T | T | T | T | S | S | S | B | T | T | T | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | I | T | N | V | A | K | F | F | S | K | I | G | V | R | S | Y | P | H | S | I | K | N | S | L | L | E | L | K | E | L | I | D | N | N | R | Y | D | I | T | I | Y | K | K | E | F | T | I | G | A | A | K | S | S | K | W | A | L | K | D | V | V | L | R | S | A | S | G | S | D | S |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | I | A | K | L | E | N | Q | L | K | R | E | G | V | D | K | I | E | E | D | A | A | T | R | P | I | E | L | F | G | T | R | N | P | K | T | V | D | I | I | D | I | K | N | N | V | Q | M | D | H | K | D | I | K | V | T | A | K | I | L | S | I | F | D | N | G | N | N | V | T | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | T | B | T | T | S | S | S | B | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 280 |
Sequence | Y | L | T | R | S | T | I | E | N | P | F | E | E | L | L | K | V | Q | I | W | G | R | Q | N | L | T | L | F | F | G | N | P | N | Y | S | Y | K | R | E | E | L | T | A | C | I | G | S | I | V | D | F | T | L | I | P | R | V | L | R | V | N | E | Y | L | Y | I | K | I | W | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 290 | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | P | I | Y | A | T | L | E | S | L | L | I | H | S | R | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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