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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6jnyA_ | 1.45 | PDB header: transcription | Chain: A: PDB Molecule: antiterminator q protein; |
Added to library: Sat Jun 15 08:37:22 2019 | |
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Sequence | N | L | T | K | E | Q | H | E | W | L | N | G | W | L | E | L | W | G | A | W | V | Y | S | G | R | L | E | K | R | M | S | S | V | I | A | K | F | M | E | S | R | P | M | C | N | D | D | D | G | M | L | I | S | Q | V | V | D | S | V | M | Y | I | D | K | K | A | F | G | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | G | G | G | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | S | Y | Y | A | H | G | S | S | K | H | A | I | A | S | Y | Y | H | R | V | A | R | P | R | K | M | L | C | R | G | G | G | R | I | Q | K | P | S | L | A | T | C | R | R | E | V | D | E | I | L | N | A | S | L | F | M | I | Y | P | V | L | D | S | A | F | K | N | R | K | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |   | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | V | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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