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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6jbhB_ | 3.94 | PDB header: transport protein | Chain: B: PDB Molecule: tarh; |
Added to library: Sat Mar 7 09:37:39 2020 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | E | H | A | V | I | V | E | N | V | T | K | K | Y | K | L | F | K | R | T | S | E | R | L | L | D | M | I | L | P | G | G | Y | G | E | D | F | Y | A | L | R | N | V | S | F | T | A | D | K | G | D | V | I | G | I | V | G | V | N | G | S | G | K | S | T | L | S | N | I | I | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | B | S | S | S | S | S | S | S | S | S | S | B | S | T | T | S | B | G | G | G | S | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | G | I | L | P | P | T | S | G | T | I | K | I | D | G | Q | A | S | L | I | A | I | S | S | G | L | N | N | Q | L | T | G | R | E | N | I | E | L | K | C | L | M | L | G | F | S | K | K | Q | I | R | A | M | E | P | D | I | I | E | F | A | D | I | G | K | F | I | D | Q | P | V |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | S | S | S | T | T | S | T | T | S | T | T | S | G | G | G | G | G | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | T | Y | S | S | G | M | K | S | R | L | G | F | A | I | S | V | N | I | D | P | D | V | L | V | I | D | E | A | L | S | V | G | D | Q | T | F | A | D | K | C | L | D | K | M | N | E | F | K | E | R | G | K | T | I | F | F | I | S | H | S | I | G | Q | V | K | S | F | C | E |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . |
Sequence | K | A | L | W | L | E | Y | G | E | V | R | G | Y | G | T | V | A | E | I | I | P | Q | Y | E | K | F | L | K | E | Y | R | A | M | S | D | K | E | K | R | Q | Y | K | E | R | V | M | R | K | Q | Q | G | E | F | L | ||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | T | T | T | T | T | T | T | T | T | T | G | G | G |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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