| |||||||
Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
|
Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
---|---|---|---|
c6in8A_ | 2.20 | PDB header: membrane protein | Chain: A: PDB Molecule: sigma factor algu regulatory protein mucb; |
Added to library: Sat Jul 27 08:29:06 2019 | |
  | |
Links to external resources | |
---|---|
  | 1 | . | . | . | . | . | . | . | . | 10 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 20 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 30 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 40 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 50 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 60 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 70 |
Sequence | G | P | G | S | A | D | A | S | D | W | L | N | R | L | A | E | A | D | R | Q | N | S | F | Q | G | T | F | V | Y | E | R | N | G | S | F | S | T | H | E | I | W | H | R | V | E | S | D | G | A | V | R | E | R | L | L | Q | L | D | G | A | R | Q | E | V | V | R | V | D | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | T | Q | C | I | S | G | G | L | A | D | Q | L | A | D | A | Q | L | W | P | V | R | K | F | D | P | S | Q | L | A | S | W | Y | D | L | R | L | V | G | E | S | R | V | A | G | R | P | A | V | V | L | A | V | T | P | R | D | Q | H | R | Y | G | F | E | L | H | L | D | R | D | T |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | S | S | T | T | T | T | T | S | S | S | S | S | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | L | P | L | K | S | L | L | L | N | E | K | G | Q | L | L | E | R | F | Q | F | T | Q | L | N | T | G | A | A | P | A | E | D | Q | L | Q | A | G | A | E | C | Q | V | V | A | W | R | S | E | W | L | P | P | G | F | T | L | T | R | S | F | M | T | P | D | P | V | A | C | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | G | G | G | G | T | T | S | S | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 270 | . | . | . | . | . |
Sequence | T | Y | G | D | G | L | A | R | F | S | V | F | I | E | P | L | M | V | G | D | A | R | S | Q | L | G | P | T | V | V | V | S | K | R | L | Q | T | D | D | G | G | Q | M | V | T | V | V | G | E | V | P | L | G | T | A | E | R | V | A | L | S | I | R | P | E | |||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | T | T | T | T | S | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
Phyre is now FREE for commercial users! All images and data generated by Phyre2 are free to use in any publication with acknowledgement Accessibility Statement
|