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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6hs5A_ | 1.80 | PDB header: transport protein | Chain: A: PDB Molecule: tssa; |
Added to library: Sat Nov 24 08:31:38 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | L | V | P | R | G | S | H | M | P | I | N | L | P | E | L | L | T | P | I | S | E | A | S | P | S | G | D | D | L | L | F | S | N | E | F | D | A | I | Q | D | A | R | R | Y | D | K | E | A | D | W | G | F | V | V | D | H | A | G | E | L | L | R | T | R | T | K | D | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | S | T | S | S | S | S | T | T | B | T | T | S | T | B | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | A | V | W | L | T | E | A | L | A | L | E | D | G | I | T | G | L | T | E | G | Y | A | L | L | E | G | L | C | R | E | F | W | D | T | F | H | P | L | P | E | D | D | D | I | E | H | R | L | G | N | V | A | W | L | S | G | R | T | A | E | L | L | R | A | V | P | L | T | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | B | S | S | T | T | T | T | S | B | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | G | A | S | N | A | F | S | T | L | D | W | E | V | A | Q | H | V | A | Q | S | I | K | R | D | P | E | H | A | D | D | I | A | R | G | K | P | S | I | E | Q | I | D | A | S | R | R | V | T | S | I | A | F | Y | T | A | L | L | A | N | L | K | A | F | E | F | A | L | D | A | F |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | T | T | B | B | G | G | G | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | |||||||||||||||||
Sequence | E | E | R | L | V | E | R | A | G | D | S | A | P | S | F | R | Q | A | R | D | A | F | E | T | V | Y | R | L | A | E | R | F | A | R | E | Q | G | Y | T | |||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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