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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6h3xA_ | 2.09 | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: polyprotein; |
Added to library: Sat Mar 2 08:26:36 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | D | E | D | C | L | S | K | D | I | K | I | T | Y | Q | E | L | H | N | C | I | G | P | K | I | M | G | N | T | C | V | S | K | N | E | L | Y | S | D | L | F | S | K | N | L | V | T | E | Y | D | K | K | Y | F | E | P | D | T | V | N | D | Q | F | N | K | I | E | F | A | Q | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | S | S | T | T | G | G | G | G | G | S | S | T | T | S | G | G | G | G | G | G | G | S | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | A | H | R | M | I | L | L | E | R | I | L | Y | K | T | E | C | E | M | L | S | L | K | K | N | S | G | P | Y | N | V | A | W | R | T | Y | L | K | N | H | N | I | D | L | C | S | R | H | N | Y | K | M | I | C | Q | C | I | N | T | H | S | M | C | K | N | T | D | I | D | Y | N |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | G | G | G | G | G | S | S | S | S | T | T | T | S | S | T | T | T | T | G | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | K | E | I | E | T | Y | Y | K | S | N | A | A | A | Y | R | A | D | L | N | T | I | M | D | T | L | K | T | A | F | R | G | L | T | K | V | L | I | E | N | Y | I | E | K | D | D | S | D | A | L | K | A | L | F | S | N | I | T | D | S | V | Q | D | N | Y | Q | M | I | G | I | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | T | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | K | F | A | S | K | L | L | D | I | N | L | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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