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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6h3wA_ | 2.10 | PDB header: viral protein | Chain: A: PDB Molecule: envelopment polyprotein; |
Added to library: Sat Mar 2 08:21:25 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | G | G | G | D | F | T | T | C | L | E | T | E | S | I | N | W | N | C | T | G | P | F | L | N | L | G | N | C | Q | K | Q | Q | K | K | E | P | Y | T | N | I | A | T | Q | L | K | G | L | K | A | I | S | V | L | D | V | P | I | I | T | G | I | P | D | D | I | A | G | A | L | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | B | S | S | G | G | G | S | G | G | G | B | T | T | S | S | G | G | G | T | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | Y | I | E | E | K | E | D | F | H | V | Q | L | T | I | E | Y | A | M | L | S | K | Y | C | D | Y | Y | T | Q | F | S | D | N | S | G | Y | S | Q | T | T | W | R | V | Y | L | R | S | H | D | F | E | A | C | I | L | Y | P | N | Q | H | F | C | R | C | V | K | N | G | E | K | C |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | T | T | G | G | G | G | S | S | G | G | G | S | T | T | S | S | S | G |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | S | S | S | N | W | D | F | A | N | E | M | K | D | Y | Y | S | G | K | Q | T | K | F | D | K | D | L | N | L | A | L | T | A | L | H | H | A | F | R | G | T | S | S | A | Y | I | A | T | M | L | S | K | K | S | N | D | D | L | I | A | Y | T | N | K | I | K | T | K | F | P | G |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | G | G | T | T | G | G | G | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||||
Sequence | N | A | L | L | K | A | I | I | D | Y | I | A | Y | M | K | S | L | P | G | M | A | N | F | K | Y | D | E | F | W | D | E | L | L | Y | K | P | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | G | G | G | G | G | T | T | S |
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