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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6g8rB_ | 2.74 | PDB header: peptide binding protein | Chain: B: PDB Molecule: nuclear body protein sp140; |
Added to library: Sat Apr 21 08:33:55 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | M | R | N | L | D | E | C | E | V | C | R | D | G | G | E | L | F | C | C | D | T | C | S | R | V | F | H | E | D | C | H | I | P | P | V | E | A | E | R | T | P | W | N | C | I | F | C | R | M | K | E | S | P | C | Q | E | S | E | V | L | E | R | Q | M | C | P | E | E | Q |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | S | S | T | T | T | S | S | S | S | S | S | T | T | T | S | S | S | T | T | S | S | S | T | S | B |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | L | K | C | E | F | L | L | L | K | V | Y | C | C | S | E | S | S | F | F | A | K | I | P | Y | Y | Y | Y | I | R | L | K | E | P | M | W | L | D | K | I | K | K | R | L | N | E | H | G | Y | P | Q | V | E | G | F | V | Q | D | M | R | L | I | F | Q | N | H | R | A | S | Y | D |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | G | G | G | G | T | T | T | S | S | G | G | G | S | T | T | S | B | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | ||||||||||||||||||||||||||
Sequence | F | G | Q | M | G | F | R | L | E | A | E | F | E | K | N | F | K | E | V | F | A | I | Q | E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | T | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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