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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6g79S_ | 3.78 | PDB header: membrane protein | Chain: S: PDB Molecule: 5-hydroxytryptamine receptor 1b; |
Added to library: Sat Jun 23 09:04:41 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | S | L | P | W | K | V | L | L | V | M | L | L | A | L | I | T | L | A | T | T | L | S | N | A | F | V | I | A | T | V | Y | R | T | R | K | L | H | T | P | A | N | Y | L | I | A | S | L | A | V | T | D | L | L | V | S | I | L | V | M | P | I | S | T | M | Y | T | V | T | G | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | W | T | L | G | Q | V | V | C | D | F | W | L | S | S | D | I | T | C | C | T | A | S | I | W | H | L | C | V | I | A | L | D | R | Y | W | A | I | T | D | A | V | E | Y | S | A | K | R | T | P | K | R | A | A | V | M | I | A | L | V | W | V | F | S | I | S | I | S | L | P | P |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | T | T | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 180 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 190 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 200 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 210 |
Sequence | F | F | W | S | E | C | V | V | N | T | D | H | I | L | Y | T | V | Y | S | T | V | G | A | F | Y | F | P | T | L | L | L | I | A | L | Y | G | R | I | Y | V | E | A | R | S | R | I | L | M | A | A | R | E | R | K | A | T | K | T | L | G | I | I | L | G | A | F | I | V | C | W |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 220 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 230 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 240 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 250 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 260 | . | . | |||||||||||||||
Sequence | L | P | F | F | I | I | S | L | V | M | P | W | F | H | L | A | I | F | D | F | F | T | W | L | G | Y | L | N | S | L | I | N | P | I | I | Y | T | M | S | N | E | D | F | K | Q | A | F | H | K | L | I | R | ||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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