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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6fnnB_ | 1.85 | PDB header: hydrolase | Chain: B: PDB Molecule: 26s proteasome regulatory subunit n11-like protein; |
Added to library: Sat Jul 28 08:25:21 2018 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | A | S | A | T | A | R | V | R | I | Y | P | L | A | L | A | K | V | V | K | H | A | A | S | S | L | Q | R | E | V | A | G | L | L | V | G | K | S | A | G | K | V | L | E | I | W | D | A | V | T | G | E | Q | Y | G | T | P | A | Y | V | Q | L | D | E | M | V | M | A | K | V | A |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | T | T | S | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | E | E | L | S | K | S | D | K | N | L | Y | I | V | G | W | Y | H | S | H | P | G | L | D | V | F | L | S | P | T | D | I | D | T | Q | K | R | Y | Q | A | M | F | S | K | A | V | A | L | V | V | D | P | V | D | Y | A | K | T | R | R | I | S | S | L | K | F | K | V | F | Q | I |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | S | S | S | T | T | S | S | T | T | T | T | S | S | S | S | S | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence | S | K | E | G | R | V | V | S | L | P | V | S | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | S | B |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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