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Protein Homology/analogY Recognition Engine V 2.2 |
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Fold library id | PDB Header | Molecule | Title |
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c6ff7p_ | 4.50 | PDB header: splicing | Chain: P: PDB Molecule: pre-mrna-splicing factor rbm22; |
Added to library: Sat Mar 16 08:39:04 2019 | |
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Links to external resources | |
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Sequence | P | E | V | R | N | I | V | D | K | T | A | S | F | V | A | R | N | G | P | E | F | E | A | R | I | R | Q | N | E | I | N | N | P | K | F | N | F | L | N | P | N | D | P | Y | H | A | Y | Y | R | H | K | V | S | E | F | K | E | G | K | A | Q | E | P | S | I | S | A | F | D | L |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | S | T | T | G | G | G | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | S |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 80 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 90 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 100 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 110 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 120 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 130 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 140 |
Sequence | D | V | V | K | L | T | A | Q | F | V | A | R | N | G | R | Q | F | L | T | Q | L | M | Q | K | E | Q | R | N | Y | Q | F | D | F | L | R | P | Q | H | S | L | F | N | Y | F | T | K | L | V | E | Q | Y | T | K | P | P | K | G | L | F | S | K | L | K | K | E | A | E | N | P | R |
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) | T | T | T | G | G | G | G | G | G | S | T | T | S | T | T | T | T | T |   | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 150 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 160 | . | . | . | . | . | . | . | . | . | 170 | . | . | . | . | . | ||||||||||||||||
Sequence | E | V | L | D | Q | V | C | Y | R | V | E | W | A | K | F | Q | E | R | E | R | K | K | E | E | E | E | K | E | K | E | R | V | A | Y | A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Predicted secondary structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SS confidence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Known secondary structure (DSSP) |
Download: | PDB structure | FASTA sequence |
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